Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms