Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZC3H12CQ9C0D7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZC3H12CQ9C0D7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms