Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms