Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms