Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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