Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYTL4Q96C24 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL4Q96C24 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms