Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms