Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CARMIL3Q8ND23 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms