Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms