Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl2Q6PA06 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms