Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms