Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms