Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms