Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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COL4A6Q14031 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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COL4A6Q14031 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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COL4A6Q14031 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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COL4A6Q14031 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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