Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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