Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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