Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms