Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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BNIP1Q12981 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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