Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP7AQ04656 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms