Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX10P56693 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX10P56693 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX10P56693 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX10P56693 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX10P56693 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX10P56693 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX10P56693 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX10P56693 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX10P56693 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX10P56693 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX10P56693 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX10P56693 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX10P56693 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX10P56693 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms