Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms