Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms