Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXP28300 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXP28300 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms