Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms