Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms