Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN3BO60391 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms