Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPATO15228 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPATO15228 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPATO15228 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPATO15228 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPATO15228 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPATO15228 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPATO15228 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPATO15228 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPATO15228 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNPATO15228 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNPATO15228 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNPATO15228 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNPATO15228 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNPATO15228 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNPATO15228 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNPATO15228 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPATO15228 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPATO15228 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms