Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms