Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms