Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms