Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms