Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms