Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP4Q9C0A0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms