Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms