Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2Q96Q42 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms