Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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