Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms