Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms