Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms