Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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