Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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RYR3Q15413 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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RYR3Q15413 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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RYR3Q15413 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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RYR3Q15413 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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RYR3Q15413 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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RYR3Q15413 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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