Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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