Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
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