Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms