Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CRB1P82279 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRB1P82279 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CRB1P82279 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRB1P82279 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB1P82279 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB1P82279 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB1P82279 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB1P82279 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB1P82279 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB1P82279 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB1P82279 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB1P82279 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms