Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms