Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIK1P57059 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIK1P57059 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK1P57059 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK1P57059 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK1P57059 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK1P57059 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms