Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms