Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms