Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms